В 1860 г. было образовано Кубанское казачье войско. В его состав были включены Черноморское казачье войско и Хоперский и Кубанский полки Кавказского линейного казачьего войска. Насчитывалось 22 конных полка, 3 эскадрона, 13 пеших батальонов и 5 батарей. Войско ведет свое старшинство с 1696 г., от старейшего из полков Кавказского линейного казачьего войска — Хоперского полка.
Основная часть войска – черноморские казаки, проживавшие в Екатеринодарском, Ейском и Темрюкском отделах Кубанской области. Другая часть войска – линейные казаки, проживавшие на территории Кавказского, Баталпашинского, Майкопского и Лабинского отделов Кубанской области.
Решением от 10 мая 1862 г. для заселения предгорий Западного Кавказа переселялись 12400 кубанских казаков, 800 казаков Азовского казачьего войска, 2000 государственных крестьян и 600 женатых нижних чинов Кавказской армии. Они также вошли в состав Кубанского войска.
Положением о воинской повинности и о содержании строевых частей Кубанского казачьего войска от 1 августа 1870 г. устанавливался порядок войска в мирное время. В состав включалось 2 Лейб-Гвардии Кубанских казачьих эскадрона, 10 конных полков, 2 пеших пластунских батальона, 5 конно-артиллерийских батарей, 1 дивизион в Варшаве, 1 учебный дивизион.
24 июня 1882 г. утверждено положение о военной службе Кубанского казачьего войска. Служилый состав делился на 3 разряда, а строевой состав еще на 3 очереди.
Основу войска составили свободные военизированные жители. Главой был наказной атаман, который также исполнял обязанности начальника Кубанской области. Он назначал атаманов отделов, которым подчинялись выборные атаманы станиц и хуторов.
Станичный сход являлся высшим органом станичной власти, в его ведении находилось избрание правления и атамана. Правление на начальном этапе состояло из атамана и двух избранных судей, а с 1870 г. состав правления увеличился и включал атамана, помощников атамана, судей, казначея и писаря.
Кубанское казачье войско состояло из 7 отделов: Екатеринодарский, Баталпашинский, Кавказский, Ейский, Майкопский, Лабинский, Таманский.